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Xena - TCGA数据下载
2023-07-12 06:32  浏览:12621  搜索引擎搜索“手机易展网”
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1,Xena官网
浏览器中输入网址 http://xena.ucsc.edu/ ,下拉找到Explore TCGA, GDC, and other public cancer genomics resources,点击




image.png

2,选择数据集
下拉选择需要的队列,此处以BRCA为例





image.png


3.查看数据
点击 GDC TCGA Breast Cancer (BRCA) ,进入BRCA数据集,查看有哪些数据





image.png


4.下载所需数据
选择对应的文件链接,点击即可。此处以点击 HTSeq - Counts 为例



image.png


注意
此数据为count数是log转化后的,需要的时候可以自行转为count数。
记得下载probeMap,探针注释文件。
涉及预后及生存相关分析,记得下载 survival data 。

发布人:90b3****    IP:117.173.23.***     举报/删稿
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