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Clusterprofile多分组富集分析及可视化
2024-01-17 19:35  浏览:1192  搜索引擎搜索“手机易展网”
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Clusterprofile多分组富集分析及可视化

scRNA-Seq | 单细胞功能注释和富集分析(GO、KEGG、GSEA) - 简书 (jianshu.com)

R语言clusterProfiler包GO富集分析(enrichplot包、GOplot包和ggplot2绘图) - 简书 (jianshu.com)

eG <- enrichGO(gene = g_list, #需要分析的基因的EntrezID OrgDb = org.Hs.eg.db, #人基因数据库 pvalueCutoff =0.01, #设置pvalue界值 qvalueCutoff = 0.01, #设置qvalue界值(FDR校正后的p值) ont="all", #选择功能富集的类型,可选BP、MF、CC,这里选择all。 readable =T)

富集分析的类型可选BP(biological process)、MF(molecular function)、CC(Cellular Component)。

Q&A | 如何使用clusterProfiler对MSigDB数据库进行富集分析 - 简书 (jianshu.com)

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